微信小程序和支付宝小程序不通用。微信小程序和支付宝小程序是两种不同的应用开发形式，它们分别基于微信和支付宝平台，有着不同的开发环境和开发工具，也有着不同的接口和功能。
虽然微信小程序和支付宝小程序都是小程序，但是它们之间并不互通，不能在微信平台上运行支付宝小程序，也不能在支付宝平台上运行微信小程序。如果你想在微信或支付宝上运行小程序，需要分别开发出对应的小程序，并在相应的平台上进行发布和管理。
现在有一套程序可以同时生成发布多平台的小程序，比如可以同时发布抖音小程序、微信小程序、支付宝小程序等。